Tháp có cấu trúc 2 tầng, tầng trên thờ Phật, tầng dưới cho khách thăm viếng. Không gian bên trong chùa huyền bí, bốn bề hoa văn độc đáo được kết thủ công từ hàng tỷ vỏ sò, vỏ ốc; vừa tạo sự độc đáo, mới mẻ, nhưng vẫn chứa đựng nét yên bình, thiêng liêng vốn có của những ngôi chùa.

Lòng tháp Bảo Tích hình tròn đồng tâm. Mái vòm của tháp hình nón và được khảm hoa văn bằng vỏ ốc nhiều màu. Bước vào tháp, ngửa mặt nhìn lên thấy ấn tượng như đang ở giữa một chiếc vỏ ốc khổng lồ.

Còn ở bên ngoài, tháp có cấu trúc cầu kỳ với 49 tiểu tháp hình chóp, trong mỗi tiểu tháp lại có một tượng Phật, trên đỉnh mỗi tiểu tháp lại có một bảo tháp nhỏ. Từng tiểu tháp này cũng được đặt những cái tên khác nhau.

Ngôi chùa chính là điểm nhấn du lịch miền biển Ba Ngòi của vịnh Cam Ranh. Đến đây, du khách đều ngỡ ngàng bởi vẻ đẹp toát ra từ kiến trúc lạ mắt của công trình.

Những vỏ sò, vỏ ốc được kết lại thành hoa văn độc đáo trên khắp trần nhà, vách tường, cột, cửa,...

Những họa tiết, hoa văn bắt mắt kết hợp bởi các vỏ ốc, vỏ sò khiến không gian tòa tháp thêm phần huyền bí, kỳ diệu.

Đến chùa Ốc, du khách không thể bỏ qua hành trình xuống "18 tầng địa ngục", dài khoảng 500 mét, được xây dựng từ đá san hô, vỏ ốc, vỏ sò. Bên ngoài bao bọc là hình rồng đang uốn lượn quanh tháp Bảo Tích.

Đường hầm này rất quanh co và tối, phải dùng đèn pin mới đi được, điều này mang lại cảm giác thú vị cho những người thích khám phá. Tại đây, bạn sẽ được khám phá 18 tầng địa ngục tương ứng với từng tội danh khác nhau. Đây cũng là nơi để giáo dục, răn dạy mọi người sống tốt, tránh những việc sai trái trên đời.

Chùa Ốc đã được nhiều du khách trong và ngoài nước biết đến. Trải qua thời gian và mưa nắng, những vỏ ốc và san hô ở đây càng đậm màu cổ kính.

Ngoài tháp Bảo tích, trong chùa có rất nhiều công trình, tiểu cảnh độc đáo, ấn tượng.