Chùa có khuôn viên rộng gần 17.000m2. Trước đây, khi chưa xây dựng chánh điện mới, chùa có khoảng 400 cây Thốt Nốt được trồng qua nhiều đợt, có cây tuổi thấp nhất trên 35 năm, cao nhất cũng gần 90 năm. Về sau, khi chùa xây dựng lại chánh điện và mở rộng một số công trình nên phải đốn bỏ gần phân nửa, hiện còn khoảng 200 cây.

Đại đức Kim Sang, trụ trì chùa Trà Quýt cho biết, ngôi chùa bắt đầu được xây dựng cách đây khoảng 142 năm, trải qua 8 đời trụ trì. Thuở xưa, một người đàn ông có uy tín trong phum sóc tên là Trà Quýt đã tập hợp đồng bào Khmer lại để đóng góp tiền xây chùa. Với tay nghề sẵn có, ông đứng ra hướng dẫn cách xây dựng chánh điện và các công trình khác. Khi khánh thành, chùa lấy tên Trà Quýt để ghi nhớ, tri ân công lao của ông.

Chánh điện của chùa được xây theo lối kiến trúc Phật giáo Nam tông Khmer, với chiều dài 24 m, rộng 12 m, cao 19,5 m cùng hoa văn chạm trổ độc đáo mang đậm bản sắc văn hóa truyền thống Khmer Nam Bộ. Điểm độc đáo tại chánh điện là những pho tượng, bức phù điêu chạm nổi tinh xảo mang đậm dấu ấn tinh hoa văn hóa Khmer về Phật Thích Ca, linh vật, chim thần keynor, krud, reach-sey, naga…

Chùa Trà Quýt xây dựng ở một vùng nông thôn bình yên, cạnh bên là những cánh đồng lúa mênh mông. Cây Thốt Nốt ở chùa mọc tự nhiên và phát triển rất tốt, trái sum suê. Thân cây rất cứng, khi chặt, lõi cây đen mun cứng như sắt. Ngôi chùa thường có nhiều người đến tham quan, chụp ảnh. Du khách đến Sóc Trăng đều ghé thăm chùa Trà Quýt để được chiêm ngưỡng hàng trăm cây Thốt Nốt mọc xanh tươi, khoe dáng cao vút và ngắm từng đàn chim cu, sáo, dơi... bay lượn.

Cây thốt nốt là biểu tượng của chùa Trà Quýt nên sư sãi và Phật tử luôn cố gắng giữ gìn. Hằng ngày đều có người quét lá, lượm trái để không gian chùa luôn sạch đẹp.